蠕动泵在输送流体的过程中，流体在硅胶管里运行，这样就避免了泵体对流体的污染。蠕动泵对流体的输送是靠硅管被挤压过程中达到的目的，固此不会产任何剪切力和热效应，流体的活性也就不会被破坏。所以在世界上被广泛应用到生物医学工程方面。在生物制品方面蠕动泵广泛应用到血浆浓缩，蛋白质及酶的浓缩或脱盐，血清的渗析，细菌病毒疫苗的浓缩、细胞的收集等等。
硅胶管夹在壳体和泵头的三辊之间，壳体内经和三辊之间的间隙是硅胶管的双壁厚度之和．蠕动泵泵头随电机旋转时三辊不断挤压硅胶管，使硅胶管中的流体也连续稳定的挤出。随着挤压点的前移后部叉形成真空而使流体吸入泵内。这样，随着蠕动泵泵头转速的改变，流量也随着改变。
