1. 集装箱货运站出入口布局
集装箱码头货运站的任务主要是货物集中或疏散的作业场所，因此，其出入口要尽量与铁路、公路直接连接。
集装箱码头货运站通常把拼箱货物的出入口和集装箱卡车的出入口分开布置，一般都采用正对面布置的形式.也就是集装箱货运站的一侧靠运货卡车（一般称卡车侧）、用于拼箱货物的出入；门对面的另一侧则靠集卡（一般称集装箱侧），用于集装箱的拼箱或拆箱作业、当然如果临时要装、拆大量集装箱时，两侧都可以靠集卡进行作业，
2.集装箱货运站间档尺寸选择
货运站两侧设有许多站门，运货卡牛和集装箱拖车就停靠在站门口进行作业，停靠运货卡车或集装箱拖车的位置（所占的间档）称为车位（dock或 bay），以前一个车位停靠--辆运货卡车或一辆集装箱拖车，其宽度一般为3.6—4米，这样的宽度从作业时的操作来看，显得比较狭窄，所以现在货运站一个间档一般同时停两辆卡车作为一对（pair），其间档的宽度可取7.5 8米。
3.集装箱货运站内外通道设计
货运站内部的两侧需通行义式装卸车和其他搬运工具，所以需要留有通道，其通道宽度在集装箱侧和卡车侧通常均设计为5 -6米。集装箱侧站台的宽度，通常要考虑设置调平升降跳板（leverler），和箱门开启的需要，可取1.5米左右；而卡车侧站台的宽度，由于需考虑货物的进出，要与内部通道连接，属于主要通道，一般取1.5 2米、此外，在货运站外面卡车侧，应留有货运卡车通行的车道；集装箱侧，也应留有集装箱拖车通行的车道，其宽度至少分别为20米和25米以上。
4.集装箱货运站堆货部分面积设计
集装箱货运站中间部分的面积，是留作拼箱、拆箱货物临时进行堆放、保管和分类用的，其面积可按这样的方式确定：如每间档次内停放1个集装箱，中间面积应能容纳拼装2—3个集装箱货物的货位。如每间档次内停放2个集装箱，中间面积应能容纳拼装5——6个集装箱货物的货位。另外还要考虑货物堆装高度和货物在货运站内滞留的时间等因素，如果设定货物堆装高度为2米.货物周围已留有足够的通道。一般集装箱货运站中间部分每平方米面积，能堆7吨左右货物。
5.集装箱货运站宽度设计
如果每一个车位停靠两辆集装箱拖车，考虑到集卡上的两个集装箱后端部的箱门要能开启270度，所以箱与箱之间的间距至少需要1.25米，这样每个车位的宽度至少也需要7.5米，一般都取8.0米。这样，集装箱货运站的内部宽度应起码为50 60米。
6. 集装箱货运站高度设计
集装箱货运站的高度，如货运站内考虑采用叉式装卸车堆装托盘，一般堆放 4 层，站内净空高度就要求在5.5米以上。