公司应对劳动仲裁的方法如下：
1.可以与员工进行协商，尽量达成一致意见；
2.协商不成时，可以请求当地劳动部门进行调解；
3.必须通过劳动仲裁裁决的话，需要主动配合劳动仲裁部门提交答辩书，及参加仲裁庭审；
4.对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
根据《中华人民共和国劳动法》第七十九条劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解；调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
二、劳动仲裁有什么条件
劳动仲裁有以下条件：
1.申请仲裁必须在规定的时间内；
2.申请仲裁的争议必须是劳动争议；
3.申诉人必须是与申请仲裁的劳动争议有直接利害关系；
4.申请仲裁的劳动争议必须属于仲裁委员会的受案范围；
5.必须向有仲裁权的仲裁委员会申请仲裁；
6.有明确的被申请人和具体的仲裁请求以及事实依据；
7.申请书及相关材料备齐并符合要求。
三、劳动仲裁必须去公司所在地吗
劳动仲裁不是必须去公司所在地。申请劳动仲裁可以在公司注册地（用人单位所在地）也可以在上班地（合同履行地）。劳动仲裁的管辖问题需要到劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请。但如果劳动者和用人单位分别向合同履行地和单位所在地的劳动争议仲裁委申请，由劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会管辖。所谓“合同履行地”为可以是：实际工作场所地，“单位所在地”是单位注册、登记地或者主要办事机构所在地。