在实验室里，红外、紫外、核磁这些仪器，都要求样品达到足够的纯度，才能得到准确的结果。除了实验室，药品的生产也需要纯化，特别是生物制品和药剂。很多生物制品如果是直接吃下去，跟吃个鸡蛋也没什么不同，直接注射才能保留活性成份。而注射治疗，药物会直接进入血液，所以纯度非常重要。
在实验室里，用于制备的液相，配置和普通的分析液相差不多。有泵，有进样器，有柱子，有检测器。为了收集分离出来的化合物，制备液相通常还配一个馏分收集器。馏分收集器就像液相色谱的收纳盒，把每次分析的同类物质收纳到一起。馏分收集器可以直接串联在检测器后面。
也可以连接一个三通，和检测器并联，都接在色谱柱的后面。有些实验室里需要收集的量很大，一个馏分收集器装不完，还可以并联好几个。根据检测器的信号显示，当化合物出峰的时候，仪器会自动收集。一般按照时间编程，也可以根据检测器的信号强度自动触发。一个个化合物通过馏分收集器收集到小瓶或者试管里，也可以通过管路连接到更大的瓶子。