1.两者适用条件不同
代通知金支付的条件有三个，分别为不胜任工作解除、医疗期满解除、客观情形发生重大变化解除。只有在这三种情形下的解除，才有代通知金。
经济补偿金的支付条件很多，上述三种情形需要向员工支付经济补偿金，还有协商解除、法定裁员、员工被迫解除等诸多种情形。经济补偿金的支付条件包含了代通知金的支付条件，同时其范围更为宽泛。
2.两者的支付月数不同
代通知金为固定金额，是员工一个月的工资。经济补偿金的具体月数跟员工在本公司的工龄有关。员工工作不满半年的，支付半个月;工作半年以上不足一年的，支付一个月。之后一年按照补偿一个月的标准向员工支付经济补偿金。所以代通知为固定的一个月，而经济补偿金则基本上遵循工作一年支付一个月的补偿原则。
3.计算基数不同
代通知金的计算基数为员工离职之前的一个月工资，其不受三倍封顶限制;经济补偿金的计算基数为员工离职之前的十二个月平均工资，受三倍封顶限制。
比如一员工月薪五万元，在给此员工计算经济补偿金时，适用的基数就不应该是五万元，而应该按照市市平工资的三倍进行封顶计算，即12603元;而此员工的代通知金则应该是五万元，不应该受三倍封顶的限制。
在之前培训现场所做的调研中，发现最少有30%的hr会选择代通知金的计算基数以员工前十二个月的平均工资，之所以会选择这一错误的答案，其原因就在于混淆了代通知金与经济补偿金这两个概念。
二、是不是代通知金和经济补偿金免税？
根据《经济补偿金免征所得税问题的通知》经济补偿金是不需要缴纳个人所得税的，代通金并没有严格规定，实际操作中也不需要缴纳。
三、赔偿金和经济补偿金的区别有哪些
赔偿金和经济补偿金的区别有这些：
1.条件不同，经济赔偿金是公司违法解除劳动合同的时候需要支付的，而经济补偿金一般是用人单位正常解除劳动合同支付的；
2.性质不同，经济赔偿金属于惩罚性质的，经济补偿金属于补偿性质的；
3.数额不同，经济赔偿金是经济补偿金的两倍。