包装方式有手工包装、半自动包装和自动包装:手工包装柔性大、效率低;自动包装效率高，商品全自动进行植入、称重、包裹封装、打印贴单、检核及分等，但在包装时必须采用标准包装箱及固定品类。为了迎合全球消费低碳环保的理念，快递包装的材料与形式，关系到收货体验和品牌亲和力，兼顾对产品的保护，应尽可能地使包装合理，使用环保工艺和可再生或可回收材料。
在工作台复核、包装、打印、贴单、称重这几个先后动作中，最耗时的是包装。很多电商企业在大促前，都会将热销爆品提前打包。为了预包装、节省运费，需要控制包裹体积，此时可选择拆单，将包裹通过传送带或笼车、分拣线分配至各个发货道口或集货位，码放在出货区待揽收。在产品出库时若发生异常，例如出现单货不符、串发/错发、产品有问题、内包装破损等情况，则可将产品放到异常区域由人工处理，有时需要返工拆开一个批次的包裹进行复核。
最后的环节是发运，在快递商来取货时，仓库最好已预报发货数据，可以按货箱、笼车、托盘或包袋等批量交接，每个容器附上发货清单(shipping list)，运回分拣中心后再复核。也可以在现场逐件扫描复核，快递员在到达仓库后使用pda扫描面单进行揽收，核对包裹交接清单(handover manifest)，避免漏发、错发。这是对发货错误进行校验的最后一道关卡，也是拦截订单的最后节点。由于大多数网购订单是在下午及晚上产生的，海外仓库内截单较少，所以，通常在产生“截单指令”后，系统随时拦截需要取消、修改、误拣、误包、贴错运单、重复二次发货等的订单。大型仓配中心，在货物出库时应用包裹自动分拣线，可以自动剔除、分拨不同承运商的包裹。在收货完成确认无误后，仓库方在交接清单上签字，装车出库，装车时使用自动伸缩机或叉车工具。最后在系统中记录出库完成，给客户提供快递单号，让客户掌握后续配送进度。货物在发运后，就离开了仓库管理的范畴，进入运输环节。