房屋登记不当的处理程序为：1、撤销登记，布告其房子权属证书报废；2、由机关应对当事人的直接经济损失负补偿职责；3、依法给予行政处分或行政处罚，构成犯罪的依法追查刑事职责。房屋登记不当应该怎么处理的法律依据
《民法典》第二百二十条
权利人、利害关系人认为不动产登记簿记载的事项错误的，可以申请更正登记。不动产登记簿记载的权利人书面同意更正或者有证据证明登记确有错误的，登记机构应当予以更正。不动产登记簿记载的权利人不同意更正的，利害关系人可以申请异议登记。登记机构予以异议登记，申请人自异议登记之日起十五日内不提起诉讼的，异议登记失效。异议登记不当，造成权利人损害的，权利人可以向申请人请求损害赔偿。