①确定绩效评价的组织结构。评价工作的组织机构实施评价活动。机构成员应具备物流管理经验和财务会计专业知识，熟悉物流成本绩效评价业务，能够坚持原则，秉公办事，并具有较强的综合分析判断能力。
②制订评价方案。制订评价方案，应当明确评价对象，物流成本绩效评价的对象是整个物流系统。其次建立评价目标，选择评价标准、评价方法和报告形式。评价目标是整个评价工作的指南，评价指标是评价的具体内容，是评价方案的关键和难点。评价标准由年度预算标准和物流行业标准确定，标准选择取决于评价目标。物流成本绩效评价主要采用定量评价的方法，根据评价目标，形成绩效报告形式。
③收集和整理相关数据资料。包括物流企业以前年度的物流成本绩效评价报告，同行业的评价标准和评价方法，物流企业的各项物流作业服务数据和财务数据等。
④进行绩效评价。根据既定的评估方案和确定的评价方法，利用收集的数据资料进行实施，计算评价指标的数值。
⑤编制绩效评价报表。根据评价方案中的评价报告形式，将绩效评价的实际指标值填到报表，并对相关指标进行分析。
⑥得出绩效评价报告。对评价过程中形成的各种方面材料进行分析，并结合相关材料，得出绩效评价结果，形成绩效评价报告，建立绩效评价档案。