每个组织管理其物流部门的方式皆不相同，但其发展方向与该组织参与国际物流的程度有很大关系。
(一)出口部门
公司借助接收获取国际订单打入国际物流市场。当与国外市场的业务往来增加时，公司便会成立所谓的出口部门；公司的物流部门在此时便负责协调公司产品销往海外的运输与存货作业，作业内容大致为货物运送的控制和运送信息的传递，功能较简单。
由图中可以看出，海外部分的销售都由出口部经理全权负责，包括促销广告、订货事宜、海外物流作业与人员的决定、商品的包装与出口运送等都在出口部经理的业务范围内；若相关作业需要与国内的一般常态业务协调，便要通过出口部经理与一般业务经理协调，物流功能的层级较低。
(二)国际事业部门
若公司海外业务持续扩大，需在海外设立据点时，多会成立一个国际事业部门或分公司来负责有关的国际业务，国际事业部门的主管决定国际市场的运营并负责海外市场的扩展。
在此发展阶段，国际事业部门直接由最高主管统一管理，通过最高主管的协调，海外物流的相关作业可以得到其他运营单位的支持，资源较多。但公司的最高主管通常对于国际事业部门不会特别重视，或认为其与其他部门在国际物流的规划上较不同，从全球性的角度来规划，降低了国际事业部门的效能。
(三)多国组织
当公司不再视自己为一个向海外发展的公司，而是在全世界运营的公司时，公司的决策阶层与幕僚人员在思考公司的各项规划工作时，均会以全球性的观点做整体性的规划。负责国际物流运作的运营单位不再向国际事业部门的主管负责，而是直接向公司的最高主管或管理阶层负责，从全球原材料的购买、寻找最具生产效率的生产地点，以及将商品通过国际运送销往可获最大报酬的国家或地区，都是以全球运筹的角度在运作。