基本原理是在传统式的絮凝沉淀的物工艺中加入磁性微粒，经过絮凝、吸引、附着、电荷吸附、架桥、网捕等步骤，将水体中的藻类、微小悬浮物、胶体、细菌等不溶性污染物跟磁粉合理有效相结合，蕞终产生高密度絮凝体，依靠重力功效跟斜管(板)沉淀物基本原理，完成固液的迅速沉淀物的分离。沉淀池污泥经回流泵送磁粉污泥分离的系统回收，磁粉完成循环使用，分离出的污泥排入污泥池进行的脱水解决。
磁絮凝沉淀-黑臭水体整治设备磁絮凝污水处理设备用于污水处理域替代传统混凝沉淀、加砂沉淀、斜板沉淀的悬浮物去除新技术。它不同于传统工艺依靠重力分离悬浮物，而采用稀土永磁技术，变被动沉淀为主动的吸附打捞，使分离的效率提高，分离出的污泥含水率小于 93%。工艺水力停留时间小于5分钟，使得占地面积。在处理10000立方米每天水量的全套设备装机功率仅40余千瓦。