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RT-PCR反应体系详解

2025/2/15 13:07:12发布20次查看
pcr反应需要以双链dna作为模板,因此最初的pcr反应用于检测目标样本的基因组中是否存在特定的目的片段,但是这种以基因组dna为模板的pcr反应无法检测目的基因是否在样本中表达,此外由于真核生物的基因中存在内含子,直接通过基因组dna进行pcr也很难确定样本中是否存在目的基因,针对这一问题,发展出了逆转录pcr的技术。
rt-pcr技术原理:
逆转录pcr (reverse transcription pcr,rt-pcr) 是以mrna为模板,在逆转录酶作用下合成cdna,之后再进行pcr的过程。
mrna逆转录合成cdna的过程分为两步:
在特定引物的介导下,通过逆转录酶的催化下以mrna为模版合成互补的cdna第一链;
升高温度使cdna第一链与mrna解离,然后降温,使其与另一引物退火结合,并由dna聚合酶催化延伸生成cdna第二链。
rt-pcr使rna检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量rna样品的分析成为可能,该技术主要用于分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cdna探针、构建rna高效转录系统。
逆转录反应体系:
1. rna模板
通常20μl的逆转录体系,加入总rna 1μg,如果总rna加入过多,会导致逆转录不充分。
2. 引物
常用的有随机引物和oligo(dt)引物:
随机引物会将所有rna分子均进行逆转录,此时得到的cdna大部分来源于rrna,主要在部分mrna含有逆转录酶终止序列而难以得到其全序列时使用;
oligo(dt)与真核生物mrna的poly(a)区域匹配,可以特异性的对mrna进行逆转录。
3. 逆转录酶
逆转录过程涉及以rna为模板合成dna和以dna为模板合成互补链的两个过程,目前市场上的逆转录酶都同时具有这些功能,因此只需在反应体系中加入逆转录酶即可,而不需额外加入dna聚合酶。
4. 4种dntps
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