离子色谱仪技术的类型分别为离子排斥色谱、离子交换色谱以及离子对色谱三种类型。离子排斥色谱主要是利用固定相和溶质之间的非离子性的相互作用进行相关离子的分离，离子交换色谱则是以离子间作用力的不同进行阴阳离子的有效分离。
离子排斥色谱主要应用于有机酸和有机弱酸的分离，也可以用于氨基酸、醇类以及糖类的分离。离子对色谱的分离原理基于分离和吸附的选择性，与流动相的性能密切相关，主要应用于金属络合物以及表面活性阳离子的分离。
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