生物安全柜其广泛应用于微生物学、生物医学、基因工程、生物制品等领域的科研、教学、临床检验和生产中，是实验室生物安全中一级防护屏障中基本的安全防护设备 。
生物安全柜的工作原理主要是将柜内空气向外抽吸，使柜内保持负压状态，通过垂直气流来保护工作人员；外界空气经空气过滤器( high-efficiency particulate air filter, hepa过滤器)过滤后进入安全柜内，以避免处理样品被污染；柜内的空气也需经过hepa过滤器过滤后再排放到大气中，以保护环境。
当实验室为一级时一般无须使用生物安全柜，或使用ⅰ级生物安全柜。实验室为二级时，当可能产生微生物气溶胶或出现溅出的操作时，可使用ⅰ级生物安全柜；当处理感染性材料时，应使用部分或全部排风的*；若涉及处理化学致癌剂、放射性物质和挥发性溶媒，则只能使用ⅱ-b级全排风(b2型)生物安全柜。实验室为三级时，应使用ⅱ级或ⅲ级生物安全柜；所有涉及感染材料的操作，应使用全排风型ⅱ-b级(b2型)或ⅲ级生物安全柜。实验室为四级时，应使用ⅲ级全排风生物安全柜。当人员穿着正压*时，可使用ⅱ-b级生物安全柜。