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DNase I 溶液 说明书

2024/12/12 11:51:24发布28次查看
产品简介:
dnase i , 即 deoxyribonucleasei, 即脱氧核糖核酸酶 i, 是一种可以消化单链或双链dna产生单脱氧核苷酸或单链或双链的寡脱氧核苷酸的核酸内切酶。dnasei水解单链或双链 dna后的产物, 5'端为磷酸基团,3'端为羟基。
dnasei活性依赖于钙离子, 并能被镁离子或二价锰离子激活 。镁离子存在条件下,dnasei可随机剪切双链 dna的任意位点;二价锰离子存在条件下,dnasei可在同一位点剪切 dna双链,形成平末端, 或 1 -2 个核苷酸突出的粘末端。
特点:不含 rnase(rnasefree), 可以用于各种 rna样品的处理 。提供了用于 dnasei 失活所需的 edta。
用途:制备不含 dna的 rna样品;rt-pcr反应前 rna样品中去除基因组 dna等可能的 dna污染;体外 t7, t3, sp6 等 rnapolymerases催化的 rna转录后去除 dna模板;dnaseifootprinting研究 dna-蛋白质相互作用; 缺口平移(nicktranslatioin); 产生 dna随机片段文库; 细胞凋亡 tunel检测中部分剪切基因组 dna作为阳性对照。
来源:从牛胰腺纯化得到 。分子量: 约 32kda(单体)。
活性定义:37°c10 分钟内,将能够降解 1 μgpbr322 质粒 dna所需的酶量定义为1个活性单位。
活性检测条件:40mm tris-hcl(ph8.0) , 10mmmgso4, 1mmcacl2 , 1 μgofpbr322dna。纯度:不含其它 dna内切酶和外切酶,不含 rna酶。
保存条件:
-20°c保存, 一年内有效。
操作流程:
1 rt-pcr反应前 rna样品中 dna的去除:
1.1 dna模板限制性核酸内切酶作用后线性化。酚/氯仿和氯仿/异丙醇提取 dna,用乙醇沉淀后, 溶于适量的无菌去离子水中。
1.2 向一无 rna酶的 ep管中依次加入下列试剂:
rna
1 μg
反应缓冲液(10×)
1μl
补充经 depc处理的去离子水
至9 μl
dnasei(1u/μl)
1μl
注意:如需处理较大量的 rna样品, 可以按照比例放大上述反应体系 。如果能在上述反应体系中加入适量 ribonucleaseinhibitor以防止 rna降解则更佳。
1.3 37°c孵育 30min。
1.4 向上述反应体系中加入 1 μl25mm edta,65°c 孵育 10min, 以失活 dnase i 。注意:在 没有鏊合剂如 edta等存在情况下加热, rna可被水解。
1.5上述加热处理过的 rna样品即可直接用于处理好的 rna可用作 rt-pcr反应的模板。
2体外 rna反转录后模板 dna的去除:
2.1 在每含有 0.5 μg模板 dna的反转录反应体系中加入 1udnasei。注意:在某些情况下,模板 dna消化所需的 dnasei的量需通过实验进行摸索。
2.2 37°c孵育 15min。
2.3 酚/氯仿抽提失活 dnasei。
3缺口平移进行 dna标记
3.1 参考如下表格设置反应:
reactionbuffer(10×) fordnapolymerasei
2.5 μl
3dntpmixture(1mmeach, withoutthelabeleddntp) *
1.25μl
[α -32p]-dntp, ~110tbq/mmol(3000ci/mmol)
1.85 -3.7mbq(50 -100μ ci)
dnasei(freshlydilutedto0.002u/μl)**
1μl
dnapolymerasei, e.coli
0. 5-1.5 μl (5 -15u)
templatedna
0.25μg
补充无核酸酶去离子水
至25μl
*3 dntpmixture(1mmeach, withoutthelabeleddntp):分别取除已经标记的 dntp外的 3种 dntp(100mm) 各 1 μl加入到 97μl的无核酸酶的去离子水中混匀即可 。例如标记的为datp,则需混合 dttp、dctp和 dgtp三种 dntp至每种的最终浓度为 1mm。配制好的 dntp 可存放于 -20°c以备后续使用。
**dnasei可以用 1 × reactionbufferfordnapolymerasei进行稀释。
reactionbuffer(10 ×) fordnapolymerasei: 500mmtris-hcl(ph7.5 at25°c) , 100mm mgcl2 , 10mm dtt。
3.2 立即 15°c孵育 15~60min。
3.3 上述反应体系中加入 1μl0.5medta(ph8.0)终止反应。
3.4 从中取出少量例如 1 μl检测标记效率 。通常标记效率至少可以达到 108cpm/μgdna。
3.5 可用 sephadexg-50 或 bio-gelp-60 去除[α -32p]-dntp, 以纯化获得标记的 dna。
温馨提示:
为了您的自身安全,使用试剂前,请做好防护,如穿实验服, 带手套等。
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