常用色谱柱的内径有 4.6mm 或者 3.9mm 两种规格,国内有 4mm 和 5mm 内径的产品。随着色谱柱技术的发展细内径柱受到专业人士的重视,内径2mm柱已经可以作为常用柱使用,细内径柱可获得与粗柱内径柱基本相同的柱效,而溶剂的消耗量却明显的下降,在一定程度上就降低了实验成本,也降低了废弃的流动相污染环境以及流动相溶剂损害操作人员的健康。目前市场上1mm甚至更细内径的高效填充柱都有出售,特别是在其与质谱联用时为减小溶剂用量,常会采用内径为0.5mm以下的毛细管柱。
细内径柱与常规粗柱相比有如下优点:若注射量相同的试样到细内径柱上,则产生较窄的峰宽从而使峰高增大但色谱柱不应过载,峰高的增大又能够使检测器的灵敏度提高。这种增强效应对痕量分析非常的重要,因为在痕量分析中试样的总量会受到限制。实际过程中用作半制备或制备目的液相色谱仪色谱柱的内经一般要选择在6mm以上的产品。