酸奶厂废水主要来自设备消毒冲洗，灌装设备清洗、酸奶瓶清洗以及纯水制备中排放的离子交换树脂再生废水等，废水中含有大量的可溶性有机物（糖类、脂肪酸、蛋白质、淀粉等），主要污染物有cod、bod、动植物油、ss、酸碱物质等，属中高浓度有机废水，废水可生化性好，适于采用生物法进行乳制品废水处理。
1、混凝法
混凝法是向酸奶厂废水中投加一定量的药剂，经过脱稳、架桥等反应过程，使酸奶厂废水中的污染物凝聚形成絮凝体并产生沉降。
2、气浮法
气浮是利用高度分散的微小气泡为载体去粘附酸奶厂废水中的污染物，使其视密度小于水而上浮到水面，从而实现固液或者液液分离的过程。
3、水解酸化
利用水解菌、酸化菌将水中不溶性有机物水解为溶解性有机物，将难生物降解的大分子物质转化为易生物降解的小分子物质的过程，从而改善酸奶厂废水的可生化性，为后续生化处理提供良好的条件。
4、活性污泥法
以活性污泥为主体的废水生物处理的主要方法。活性污泥法是向废水中连续通入空气，活性污泥法经一定时间后因好氧性微生物繁殖而形成的污泥状絮凝物。其上栖息着以菌胶团为主的微生物群，具有很强的吸附与氧化有机物的能力。