选择载气首先要满足检测器的要求，还要考虑到分析方法对分析周期、柱效率及灵敏度的影响。例如从柱效率考虑，要求载气的扩散系数要小，为得到好的峰型，常用氮气作载气。对tcd检测器来讲，为提高灵敏度常用传导大的氢(氦)气作载气，而不使用氮气或氩气。从安全和分析周期来讲，氦气要比氢气好，但我国的氦气资源较少，价格比较高，因此使用氢气作载气比较普遍。对于fid检测器用氮气作载气，既安全又可得到比较好的灵敏度。综上所述tcd检测器用氢气、氦气比较好，用氮气、氩气、空气时灵敏度比较低，易出现n型或w型峰。fid、fpd检测器常用氮气作载气，在特殊情况下也可用氢气。ecd检测器一般用氮气作载气。
一般载气选取原则是：
惰性气体(分析中不与样品或固定相发生化学反应)，无腐蚀性、在200~400℃范围内不分解：气体扩散系数小，以提高柱效率，价格合理、且能满足检测器使用要求。
气源的种类和纯度，应与所分析的样品和所要求达到的分析精度进行合理的选择