二者的区别主要表现为以下几点：
(一） 承运人不同
国际铁路货物联运的承运人是铁路部门，大陆桥运输的承运人是无船承运人或多式联运经营人，作为实际承运人的铁路，则受多式联运经营人的委托来负责货物运输。
(二） 运输合同名称不同
国际铁路货物联运运输合同是联运运单，而大陆桥运输的运输合同是多式联运单据。
(三） 结汇所用单据不同
国际铁路货物联运用联运运单副本结汇，而大陆桥运输则用多式联运单据结汇。
(四） 承运货物种类不同
国际铁路联运承运的货类，按其种别分为整车、零担和大吨位集装箱。国际铁路货物联运集装箱分为小吨位、中吨位和大吨位集装箱三种。而小吨位和中吨位集装箱只能按整车和零担种别办理托运。大陆桥运输以国际标准集装箱为运输单位，此类集装箱适于不同运输工具之间的转换，在国境站办理货物交接时，无须拆箱、卸载，仅办理集装箱交接即可。
(五） 承运人责任不同
国际铁路货物联运的承运人为铁路部门，负连带责任，但仅负责各自运输区段的责任；大陆桥运输的承运人为多式联运经营人，对全程运输负责。
(六） 运费构成和计算方法不同
国际铁路货物联运运送费用由发送路、到达路和过境路三段费用构成，运费按照发送国铁路、到达国铁路和过境铁路的不同规定来计算；大陆桥运输的运费由国内段运费、过境前苏联铁路运费、过境蒙古铁路和欧洲铁路运费构成。上述费用除国内段运费按有关运输规定收取外，国外的运费均与代理人签订运费协议，按协议费率向代理人支付。