1.头程服务不同：fba不提供通关服务。而一些墨西哥海外仓提供清关服务，有些还包括代缴税金、派送到仓全程服务。
2.产品入仓前的要求：fba不提供产品组装服务，并要求卖家在进货前贴上外箱标签和产品标签，如发现产品有破损，则要求退货，并予以赔偿。而墨西哥海外仓上架前会为客户提供产品整修、装配等服务。
3.仓储成本：在进入fba仓库的产品中，卖家可以通过提高产品的单位价格来分担仓储成本。对fba来说，亚马逊amazon平台可以将卖家增长商品的爆光度考虑在内，例如提高卖家的排名、赞助卖家抢夺购物车等等，这有助于提高卖家的流量和销售。而对于大型商品类产品来说，运用墨西哥海外仓的成本更高。而且卖家也必须自己在站内外做推广，以提高店铺业绩。
4.支持退换货：亚马逊amazon是无条件地支持买家退换货的，而且fba仓库不会对退货的商品进行鉴定，也不会向买家收费。亚马逊amazon不会再向第二个买家出售商品，即使退货的产品没有质量问题。而如无质量问题，墨西哥海外仓会认为将其退回并更换标签，或更换包装后重新出售。
5.选品要求：亚马逊fba仓对产品的尺寸、重量、种类都有一定程度的限制，所以选品偏爱体积小、利润高、品性好的产品；而墨西哥海外仓，选择规模要大于fba仓多一些，即能进入亚马逊fba仓的产品必然会进入第三方海外仓，但能够进入第三方海外仓的产品也不一定能进入fba仓。
6.处理产品差评：fba仓而产生的差评，可由亚马逊amazon删除，卖家不必担心。而墨西哥海外仓不一定能够提供售后服务和投诉服务，因为海外仓所带来的中间差评，即使提供了这种服务，也不一定能很好地消除客户留下的中差评。
无论是选海外仓还是fba，两者都有各自的优势，跨境卖家最主要的就是看自己的需求来选择。fba因为亚马逊amazon负责发货，对卖家来说更节省时间，而海外仓价格适中，而且更灵活，避免海外仓乱收费的事情，主要是自己联系海外仓。找到可靠的海外仓库，搞清楚成本，可以避免乱收费。