物流成本绩效评价，其评价结果是否正确、能否真实地反映物流成本的控制情况、是否能达到绩效评价的目的，是一个首要问题。解决这个问题的关键和难点，在于设计科学、合理的评价指标体系，设计评价指标体系是整个评价工作的核心。物流成本绩效评价指标体系的设计必须遵循四个原则。
1.目的性原则
物流成本绩效评价指标体系的目的在于衡量企业的物流成本管理水平,发现企业管理中存在的问题，不断完善物流成本管理和提高物流成本控制水平，最终增强企业的竞争力。
2.系统性原则
与其他系统不同，物流系统运行中一个典型的特点是存在“效益背反”关系。不同物流活动之间可能在目标、运作、成本上存在冲突。因此，在构建物流成本控制绩效评价指标体系时，要充分考虑企业物流活动运行的系统性。
3.可操作性原则
可操作性原则是设置绩效评价指标体系必须考虑可操作性。可操作性是指指标数据收集的可能性，指标设计尽量与现行的统计指标、会计指标、业务核算指标统一，同时，指标体系应简单、明了，便于操作使用。
4.定量与定性相结合的原则
我国现行财务制度规定，物流成本不实行单独核算，基本上是根据会计报表的分类方法，把成本分为生产成本和销售成本，物流成本混在其中。因此，无法获取物流成本的真实数据，不利于物流成本的有效控制，再加上物流成本控制绩效涉及客户满意度等企业形象问题，难以量化，所以评价指标体系的建立除了对物流成本现效的量化指标外，还使用一些定性的指标。