1、对象不同。申诉的对象是已经发生法律效力的判决、裁定，而上诉的对象是尚未发生法律效力的一审判决、裁定。
2、主体范围不同。申诉的主体是当事人及其法定代理人、近亲属;上诉的主体是被告人、自诉人、附带民事诉讼当事人及其法定代理人、经被告人同意的被告人的辩护及及近亲属。
3、受理的机关不同。受理申诉的机关既包括原审人民法院及其上级人民法院，也包括与上述各级人民法院对应的人民检察院;而受理上诉的机关只能是原审人民法院及其上一级人民法院。
4、期限不同。对于申诉，刑事诉讼法没有规定期限，但最新的司法解释了申诉的期限，一般为刑罚执行完毕2年内，请参见下面有关申诉受理的内容;而对于上诉，法律规定了期限，即对判决、裁定提起上诉的期限分别是10日和5日。
5、后果不同。申诉只是提起审判监督程序的一种材料来源，不能停止生效判决、裁定的执行;而上诉必然引起二审程序，导致一审判决、裁定不能生效。