不会自动注销，而是会被吊销。超过一定年限没有年度申报的，会被工商局吊销营业执照。 同时因为营业执照被吊销的，该公司的法人会被列入黑名单，三年内不能担任企业高管、法人。 建议去注销该营业执照。
二、企业营业执照怎么注销
营业执照注销流程：
1.成立清算小组，对公司内部资产进行清算；
2.制作清算报告；
3.刊登注销公告；
4.注销税务、工商代码等。
根据我国相关法律规定，公司营业执照应当载明公司的名称、住所、注册资本、经营范围、法定代表人姓名等事项。公司营业执照记载的事项发生变更的，公司应当依法办理变更登记，由公司登记机关换发营业执照。公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
三、营业执照企业年报怎么申报的
1.打开浏览器，在百度搜索出国家企业信用信息公示系统网页，打开网页，点击登录国家企业信用信息公示系统，登录后点击企业年报。
2.点击“企业信息填报”。
3.登录成功后在新的界面点击“年度报告填写”，即可进行年报的填录。个体户，农民专业合作社年报无需申报“其他自行公示信息填报”。
4.选择填报的年份，点击年度报告在线填录进入年报录入，首先是基本信息的填录，根据提示进行填写。
5.按照页面流程填写，保存并下一步后，进入预览并公示页面，浏览自己所填录的信息，再次确认自己所填信息的有无错误的地方。
6.确认无误后，点击提交并公示，提交确认后，将会在公示系统中公示年报信息。