显微镜使用完后要罩上防尘布，为了防止显微镜受到尘染，防尘布要定期清洗(一个月清洗一次)。
保持显微镜的电压稳定，严禁在使用过程中突然关掉电源。
严禁频繁开关汞灯电源，在打开汞灯后15分钟内不要关闭电源，第二次重新开机间隔时间不得低于10分钟。
保持显微镜的清洁，光学部分和照明部分只能用擦镜纸进行擦拭。
在移动载物台观察试片时，不允许快速移动载物台，以免碰伤物镜镜片。
被检查的试样必须干燥无水，试样表面无油污，机械划伤等。
调节焦距时不得使试样或者载物台与物镜接触。
在正常情况下不得任意调动光学系统及任意拆卸或擦拭。
使用完毕，应先将光线调到最暗，再关闭电源。
不允许随意拆散显微镜上的物镜。
严格按照操作规程进行操作，禁止违规操作。
显微镜上的目镜、物镜表面有灰尘时，应先用吹气球吹，再用棉签蘸清洁液擦拭，方法是由内向外螺旋型擦拭。