保险的本质是分散风险、补偿风险。除了物流环节有风险外，国际贸易本身也有很多风险，如贸易诈骗、货打水漂，因此在贸易商大宗出口时都会买运输保险。许多出口企业对在外贸网上结识的贸易对象辨析不足,仅通过网络沟通就盲目发货，往往遭遇定金欺诈、提货跑路的情形。例如，对方不守信誉，滥用不合理的单边贸易条款，货到目的港后以各种借口拒付或少付货款，或先是骗取信任与其签订出口合同，开始时信守承诺，在发货人放松警惕后再开始行骗。由于电商货值低，货主及收件人又非常分散，因此传统保险产品普遍缺少对包裹类业务的风险转移覆盖。
近年来，保险公司或经纪商也推出了一些针对跨境电商的保险产品。对出口包裹投保，全损/丢失险的投保费率约为货值的1%-5%，最低免赔额为50-100元;延误发生概率高、数量大，延误险的费率可达运费的1%以上，或固定按单收取，如0.1元/件。中间物流商自身也很有必要与承运商签订时效赔偿或保险协议，承运人对运输过程中货物的毁损、灭失承担损害赔偿责任，如在清关后到仓库途中丢货。对货物的打包一定要严实，让货物能经得起长途运输的碰撞。客户合同可能会要求包含因物流造成的间接损失的赔偿诉求，当索偿范围不明确时，要视情况而定。