在国务院的直接领导和有关部委的配合支持下，海关总署会同公安部、铁道部、交 通部、信息产业部、外经贸部、人民银行、税务总局、民航总局、工商总局、质检总局、 外汇局，按照“电子底账+联网核查”管理模式于2000年底完成了我国电子口岸系统建 设。“电子底账+联网核查”取得了初步成效。
2001年5月，经中央机构编制委员会办公室批准，海关总署成立了中国电子口岸数 据中心，主要承担中国电子口岸系统集成、网络平台建设、应用项目开发和系统运行维 护，为政府管理部门和全国500多万家进出口企业提供全程电子政务服务。为了适应我国 电子口岸业务快速发展的需要，2002年10月，经中央机构编制委员会办公室批准，在全 国41个直属海关所在地设立数据分中心。分中心系各直属海关直属事业单位，负责承办 本地区政务卡、企业卡的录入、制作和为本地区联网企业提供技术支持、操作培训、热 线咨询等各项服务工作，进一步保证了电子口岸应用项目的顺利推广及正常运行。
我国电子口岸的主要作用如下：
①建立进出口货物电子底账，实施综合治理。国家有关行政管理部门分别将各自掌 握的企业档案、合同、报关单、核销单和舱单等电子数据集中存到公共数据中心，并实 行联网核查，从根本上杜绝利用假单证走私、骗汇、骗税等违法犯罪活动，提高了政府 部门综合管理效能。
②促进政务公开，加强廉政建设。“电子底账+联网核查”管理模式使国家行政管理 部门的执法行为更加规范、统一和透明，并在各部门之间和作业环节之间形成一种相互 制约、相互监督的机制，从而增强了廉政建设的力度。
③降低贸易成本，提高贸易效率。中国电信结合我国电予口岸业务的特点，推出了 全国统一的95199拨号、宽带和专线三种接入方式，企业只要从电信公网“一点接人”， 就可以透过公共数据中心向海关、国检、外贸、外汇、工商、税务、银行等部门和单位 申办各种进出口手续，既节省时间，又减少奔波劳累之苦，从而提高贸易效率，降低贸 易成本。
我国电子口岸的推广应用，在加强政府监管，打击走私、骗汇、骗税，提高贸易效 率等方面取得了显著的社会效益和经济效益。