1、軟包裝凹印機採用的都是卷──卷的配置型式，具體配置型式有三種：
a. 放卷──印刷──收卷
b. 放卷──印刷──塗布/復合──收卷
c. 雙放卷──印刷──雙收卷（串聯式結構）
顯然，與紙張/紙板包裝凹印機相比，配置較簡單。連線加工配置完全不同於紙張凹印機，主要是塗布，復合等，不會採用連線橫切、連線模切等單元。
2、由於材料厚度較小，一般放/收卷直徑不大，因此結構可以較緊湊。有時放卷和收卷直徑可以很小（如不超過600毫米），放卷架可以與輸入部分在同一個單元上，而輸出部分可與在收卷架同一個單元上
3、由於材米厚度較小，料帶交接只採用搭接方式，而不需要採用對接方式。
4、預處理裝置與紙張凹印機上預處理裝置不同。由於薄膜材料的著墨力不如紙張類材料，材料的表面處理是成功印刷的重要因素之一。因此，經常在放卷部分出口處安裝如下預處理系統：電暈處理器和預加熱滾（預處理滾）。而在紙張凹印機上的預處理通常是除塵、展平、和溫濕度處理（滾筒、單面或雙面預處理箱）。
5、由於大多數是伸展性材料，因此整機張力較小，而張力控制系統的精度、靈敏度、穩定性比一般紙張凹印機要求更高。特別是需要放卷部分和輸入部分有很高精度的張力控制系統，以使進入第1個印刷單元之前的料帶處於非常穩定的狀態。同時張力檢測必須採用行程較大的浮動輥。
6、由於大多數材料是伸展性材料，走料路徑的佈置要更嚴格（包括兩個壓印點之間的距離、料帶包角等。）過渡輥直徑較小；對於可能使用鋁箔的凹印機，必須特別考慮過渡輥的結構，通常要求採用光輥，並盡量縮短路徑。
7、由於張力較小，料帶導向裝置一般不需要使用液壓驅動機構。
8、由於部分軟包裝材料是熱敏性材料，因此，乾燥和冷卻系統的設計必須特別注意。
9、由於表面光滑，細微層次再現較好，因此一般不使用靜電輔助移墨（esa）系統。雖然有些軟包裝凹印機也安裝此類裝置，但主要是針對特殊產品和可能進行紙張印刷。
10、由於大多數材料是透明薄膜，因此料帶導向裝置一般不採用光電傳感器，而採用氣動或超聲波傳感器。由於同樣原因，套准掃描頭、圖像觀測儀系統等需要加裝反射板。
11、由於壓印力和張力較小，與紙張和紙板凹印機相比，一般機器寬度更大；使用套筒型印版滾筒較紙張凹印機上多。
12、由於反面印刷和塗布較為常見，因此雙向放卷/交接紙和正反面印刷單元較常見。