公司自主放假不扣工资。用人单位非因劳动者原因停工、停产，在一个工资支付周期内按劳动合同规定的标准支付劳动者工资；超过一个工资支付周期的，劳动者提供正常劳动则支付工资不得低于当地的最低工资标准；没有提供正常劳动，应支付生活费。公司自主放假是否需扣工资的法律依据
《工资支付暂行规定》第十二条
非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理。