畜禽粪便处理设备智能高温好氧发酵处理工艺流程包含混料部分、高温好氧发酵部分、自动收料部分三个过程。高温好氧发酵部分：该过程可分为快速升温阶段、高温阶段、降温阶段。物料进入发酵室内，在1-2天内快速分解，释放的热量使物料温度快速升高，温度一般为50～65℃。高可达到80℃。
通过送风系统向发酵室内均匀送氧，满足发酵过程氧气量需求，使物料充分发酵分解，高温阶段维持48小时。当分解速度缓慢下降时，温度逐渐降低。整个发酵过程持续2天。温度升高与通风充氧加快物料水分的蒸发，从而减少物料体积，达到物料的减量化、稳定化的处理目的；发酵室温度在50℃以上维持48小时，可以较好的杀灭虫卵、病原菌和杂草种子。符合国家《畜禽粪便无害化标准》（gb7959-87）处理要求，达到污泥无害化处理的目的 。
畜禽粪便处理设备从内到外分别由不锈钢网带、隔热材料、钢板三部分构成，耐久保温。配套送风系统，可根据畜禽粪便处理设备内发酵状态，随时调整送风量。
总体来说，目前规模养殖场有机废弃物的处理方案尚处探索阶段。除了采用生态循环、粪尿全部用作肥料的模式的小规模养殖场，中大规模猪场比较认可异位发酵池处理模式，因而该模式成为优先选择的方向，畜牧主管部门也在大力推广。