花了很久时间，终于搞定了iis6和tomcat的整合。现在把步骤贴出来给各位一点参考，也免去了新手在google上暴走和一次次的调试。开始吧！
首先先说明我的系统，windows 2003 server中文版+iis6+tomcat5.0.14，jdk 1.4.2安装目录为c:\jdk,tomcat安装目录为c:\tomcat,环境变量java_home和tomcat_home都已设置好并指向其各自的安装目录。(注意，接下来所有文件中涉及到tomcat路径的请自行修改为自己的tomcat路径)
tomcat5和iis6的安装我就不说了，网上的文档很多，假定此时我们已经安装好了tomcat5和iis6并都能独立运行，两者的默认网站均指向c:\web目录。
现在我们要做的是到http://apache.linuxforum.net/dist/jakarta/tomcat-connectors/jk2/binaries/win32/jakarta-tomcat-connectors-jk2.0.2-win32-iis.zip 去下载jk2,由jk2负责iis和tomcat的通讯，解开后得到isapi_redirector2.dll，我把它放在了c:\tomcat\iis下（目录随便）。
接下来在tomcat安装目录下的conf目录下建一个workers2.properties文件，把下面这段东东拷进去保存。注意file=..之中的路径要用/哦！