一位林业专家在接受媒体采访时发出这样的结论和悲叹：照现在的项目规划，云南森林即将遭受灭顶之灾。
结论是从对金光集团与思茅市、文山州、临沧市签订的协议中分析出来的。以思茅为例，金光集团将控股和独资建设年产120万吨纸浆、50万吨纸的纸浆项目，并配套建设1065万亩原料林基地。
这位专家分析，根本就没有可供建设原料林的林地。从现有林地资源来看，经过多年的林业生态建设，思茅市森林覆盖率非常高，无林地只有280万亩。如果真是按协议建设1000多万亩纸浆林，只能是“毁林造林”，砍毁已有林地上的森林。
与此相应，林纸原料林要等六七年后才能采伐，纸浆项目却只需一二年便可建成。由此推论，该纸浆项目只可能采伐利用现有森林资源，每年需采伐蓄积量600多万方，按思茅市目前用材林净生长量仅200多万方计算，每年将造成资源赤字400多万方。如果只采伐针叶林，则用不了几年就可以将思茅市的针叶林全部伐光。
专家强调的是，这样的行为和结果还将是严重的违法行为。《森林法》第二十九条规定，“国家根据用材林的消耗量低于生长量的原则，严格控制森林年采伐量”，“审核发放采伐许可证的部门，不得超过批准的年采伐限发放采伐许可证”。国家林业局《关于严格天然林采伐管理的意见》也提出：“杜绝大面积砍伐天然林，禁止将天然林分改造为人工林分”。
西南林学院副院长、生物多样性专家杨宇明也是对金光林纸项目持保留态度的学者。他对可能发生的大面积“毁林造林”表示忧虑，他说，云南省是经过长时间的努力才于近年消灭了森林赤字，实现了森林覆盖率和活立木蓄积量的双增长，任何一个林业工作者和环保人士都清楚地知道它的来之不易。
他回忆说，新中国成立以来，云南森林大规模超量采伐而出现森林赤字有过三次，第一次是50年代人民公社化大炼钢铁时期，第二次是“文革”10年动乱的无政府时期，第三次是80年代初期农村经济改革后的大发展时期。三次大规模的森林资源消耗给云南省的自然生态环境造成了严重的不可逆转的毁坏。在人类追求生态文明的今天，不应该再出现破坏森林的悲剧。
杨宇明最为担心的是，原料林基地将大量种植桉树，这对生态环境也会有破坏。原产澳大利亚的桉树，在中国种植面积已达150万公顷，虽然为荒山造林、绿化做出了贡献，但会带来包括土壤肥力、水分过度消耗、土地生物多样性减少等问题。有学者曾对桉树与云南本土树种进行过对比试验，证明桉树对水土保持和自我更新能力不如本地树种，大面积连片种植会导致土地贫瘠。
此外，林地、林权流转方式和企业选择等方面也受到了指责。有的专家闻讯金光集团面临严重的债务危机，是想通过“席卷林业”摆脱危机。具体知道的情况是，金光承包林地价格太低，每亩50年仅40元，每亩地每年承包费仅0.8元，损害了林权所有者的利益。
归纳起来，这些质疑的声音主要集中在四个方面：一是规模问题，规划面积太大，云南森林资源不能承受；二是流转方式问题，林地流转中损害了林权所有者－－国家或林农的利益；三是树种选择问题，大量种植桉树会破坏生态；四是企业选择问题，金光集团财务不好。
金光集团在澜沧的造林行为也部分验证了这些反对的声音。据国家林业局的最新调查，金光公司在2003年和2004年完成42万亩造林面积中，共涉及有林地9500多亩。
一些人士还从先期建在思茅的林纸一体化项目云景林纸公司的做法想象金光可能的行为。据调查，云景公司在采伐原料林基地中，采伐地块面积在1000亩以上的有100多个，严重违反了《森林采伐更新管理办法》关于“皆伐面积不得超过5公顷”，“坡度平缓，土壤肥沃，容易更新的林分可扩大到20公顷”的规定。
在舆论对云南林纸项目给予极大关注后，省政府研究室成立了调查组，专题开展“云南林纸产业发展研究”，并于2004年10月份举行了高层专家论坛，组织各方面人士共同交流探讨。云南省政府研究室还专门编制了一个“云南林纸产业发展20问”，对外界关心的问题进行回答。