反应器发生“酸化的主要原因是产甲烷菌被抑制，而厌氧反应器的容积负荷是由污泥负荷决定的，田烷菌活性降低，直接反映了污泥负荷的下降。所以在发生“酸化时应及时控制进水，情况严重时应停止进水。
2、投加碱度
厌氧反应器“酸化时，可以向反应器中投加碱度中和过高的vfa来维持ph值的稳定，保证产甲烷菌的生存环境，防止严重“酸化。nahco3、na2co3、naoh、ca(oh)2等都是常用来调节碱度的化学药剂，虽然投加naoh或者ca(oh)2等强碱性物质够快速提高反应器内的ph值，但是氢氧化物会消耗产甲烷过程所需的co2，破坏产甲烷的进行，对产甲烷菌的恢复不利，因此不宜采用naoh和ca(oh)2。
3.清水冲洗
采用清水冲洗的方法因厂而异，如果直接使用生产用水必定造成浪费，所以厂区内必须有大量的循环水。而且循环水的温度必须较高，如果因冲洗导致反应器温度下降，同样会降低产甲烷菌的活性，得不偿失。
好氧系统出水回流具有如下优点:
①出水回流可以快速将反应器中积累的挥发酸洗出，保证产甲烷菌的生存环境:
②好氧出水cod较低，碱度较高，不会增加反应器的有机负荷;
③好氧池中的温度一般在25~30℃左右，比自来水温度高得多，对反应器的灌温不会造成太大的影响;
④一般好氧出水中do较低，不会对反应器中的厌氧微生物造成影响。
4、投加新鲜污泥
“酸化情况严重时，可以选择投加新鲜污泥，这样就可以补充反应器内的甲烷菌数量，弥补反应器内产甲烷菌活性降低的不足。条件允许时，最好投加新鲜的颗粒污泥，这样可以迅速恢复厌氧反应器的运行，因为颗粒污泥中产甲烷菌活性较其它污泥强得多。但是，市场上颗粒污泥的售价及运费都非常贵，在工程上很难让人接受。