纳税人申请减免个人所得税的具体流程：持税务登记证副本，填写《涉税事项综合申请表》，提出申请和领取《受理回执》；备齐所需资料，待主管税务机关收取资料和调查审核；凭《受理回执》领取批复。国务院可以规定其他减税情形，报全国人民代表大会常务委员会备案。怎样申请减免个人所得税的法律依据
《中华人民共和国个人所得税法》第五条有下列情形之一的，可以减征个人所得税，具体幅度和期限，由省、自治区、直辖市人民政府规定，并报同级人民代表大会常务委员会备案：（一）残疾、孤老人员和烈属的所得；（二）因自然灾害遭受重大损失的。国务院可以规定其他减税情形，报全国人民代表大会常务委员会备案。