因为水质差，又未对机组定期清洗等等原因，铁锈、污泥则会在水冷器的水侧沉积，导致管道堵塞，管道过水面积减少，从而导致增加水阻力，流量下降。但水冷器水侧上的结垢造成水冷器污垢热阻增加，引起总热阻显著变大，造成 机组换热效果降低，冷凝温度上升，压缩机能耗增加，制冷量减少，尤其严重的时候还可使制冷机丧失制冷能力。
历年我国冷水机组由于污垢的影响所引起的经济损失高达几十亿元。在机组的运行管理过程中，普遍存在轻视维护，不考虑制冷量成本及机组效率等现象。
1、由于污垢对管道的堵塞，造成管道过水面积减少，导致增加水阻力，减少了水的流量。
2、冷水机组的运行效率受蒸发温度和冷凝温度的影响，蒸发温度一定时，冷凝温度越高，其运行效率越差。
3、由于冷却塔方面的原因，致使冷却水的进口温度上升，并且由于污垢使管道堵塞，造成 冷却水水量减少，从而造成 冷凝压力的上升，冷却水出口温度过高，这必定会引起压缩机功率的变大。
4、冷却水系统中由于补充水的水质和系统内的机械杂质等因素，尤其是开式冷却水系统与空气大量接触，造成 水质不稳定，产生和积累大量水垢、污垢、微生物等，在冷凝器的换热管表面形成污垢，使冷凝器的传热恶化、效率降低，污垢通常为热的不良导体，其导热系数只有碳钢的百分之十，而与铜等热的良导体相比较，导热率相差更大。且伴随着强化传热技术的广泛应用，污垢热阻对传热过程的影响更为明显。
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