高光谱显微成像系统是一套完整的高光谱成像分析工作站，整合了vnir至swir高光谱成像技术、自动扫描技术及高光谱物质分析技术（软件），使用者只需要将放置在样品盘中的待检样品置于推扫台上，即可通过软件进行扫描控制，实时进行光谱二维影像信息的获取和保存，可同时对大量的样品或不同形状的样品进行光谱成像测量分析，包括组成成分/化学组成量化数据及其分布信息等。特点：
①光谱的波段范围广且光谱分辨率非常高。成像光谱仪获得的光谱范围可以从可见光延伸到短波红外，甚至到中红外，其波段数高达数百个，形成一条近似于连续的光谱曲线，光谱分辨率可达10nm以内。
②高光谱遥感数据立方体包含丰富的图像信息及光谱信息。在高光谱显微成像系统图像中，它在普通的二维空间图像的基础上，增加了一维光谱数据，整个数据形成一个光谱图像立方体，每一个像元的光谱数据展开来就对应为一条光谱曲线，整个数据就是图谱合一的立方体。
③描述高光谱数据的模型有多种形式，如图像模型、光谱模型与特征模型，使得数据的分析和处理更加灵活、方便。
④高光谱数据中存在大量冗余信息。因为高光谱数据是由很多狭窄的波段构成的，所含数据数量巨大，同时相邻波段之间存在空间相关、谱间相关，以及波段相关，这都导致高光谱数据中冗余信息的增多。
⑤高光谱显微成像系统具有非线性特性。其非线性出现在两个方面：一方面是地物反射太阳光的过程，是一个典型的非线性过程；另一方面是太阳入射光和地物反射光在空气中的传播，也是一个非线性的过程。