生物技术的发展日新月异，随着pcr技术和基因测序技术在各个领域的应用，包括医学方面疾病检测、农业方面转基因检测以及其他很多方面的应用等，高通量的样本核酸提取已经变得极为迫切，很多公司推出了全自动核酸提取的仪器，各种原理的都有，乱花渐欲迷人眼。如何选择一款合适的核酸自动提取仪，需要细细分析。
从提取原理上来看，主要有离心柱法、磁珠法；离心柱法全自动核酸提取仪采用离心机和自动移液装置想结合的方法，通量一般在1-12个样本，时间上和手工提取差不多，并不能提高效率，价格也不便宜，耗材还不通用，最主要是难以满足检测市场大量样本的高通量提取的需求。
基于磁珠法应用的核酸提取仪，市场常见产品的通量有8、16、32、96通道，相对于移液法，磁棒法的优点是每一步的液体不残留，因为磁棒只带走结合有核酸的磁珠，转移到下一个步骤相应的反应孔中；另外选择磁棒法的提取仪器最好要功能更齐全的，比如可以加热，每个加热槽最好独立温控，这样可以设置裂解、洗脱的不同温度；另外很重要的一点是，带动磁棒的电机和结构要确保执行快速混匀和搅拌动作的情况下能长期稳定运行，确保实验结果的准确性。磁棒法的通量常见为32通道，96通道，96通道的选择比较适合大量样本提取，因其同时运行96个孔，样本量少的话，会产生耗材的浪费，增加使用成本；而32通道的处理量相对偏少，加上对照组，往往同时检测量在24个样本左右；而且32通量的设备市场竞争激烈，市场比较混乱。