工控机的功能上不同
传统工控机由cpu卡驱动无源底板上的相关接口卡
存在隐患：
(1)cpu卡与相关外设卡这间的信号走线长，存在信号衰减与干扰。(对于高精度信号采集行业影响更大)
(2)由于外设卡要插在无源底板上，受主板驱动能力的影响有时无法驱动更多的外设卡(如有时无源底上第三块pc设备无法工作)
(3)由于底板上有桥芯片存在监容性问题
(4)传统工控机对于更*的外设没有预留接口，(如：agp槽，对于要求更高显示性能的要求无法实现，给客户带来不便要么付出更高成本采用pci显卡，或功能跟本无法实现)
优点：
(1)扩展槽较多，提供传统isa、pci扩展
(2)传统的isa、pci设备价格便宜
采用嵌入式主板，采用pc104或pci104等扩展方式
无风扇工控机系统优点：
(1)嵌入式主板一般采用pc104(相当于ias)、pci104(相当于pci)、min pci等扩展形式，信号线更短，信号衰减与干扰更小，接插更牢固、可靠。
(2)pci，isa桥芯片集成在主板上，系统驱动与监容能力更强
(3)嵌入式主板集成tv-out，audio,单双网口，多串口、多usb口等主流接口，为客户提供了更丰富的接口，使客户扩展更容易。成本更底。
(4)而lcd接口又是嵌入式主板的一大特色，它可以使用户直接连接液晶显示屏，比传统的vga模式减少了a/d转换的麻烦，减少安全隐患。
(5)不仅可以上标准的操作系统，同时提供嵌入式操作系统：windos ce、linx、windos xpe等，使系统更简洁、启动更快、稳定性更高，同时避免了意外关机造成的系统损坏等问题。