医疗事故的行政处理是指卫生行政部门应当依照有关法律、行政法规、部门规章的规定，对发生医疗事故的医疗机构和医务人员作出行政处理。卫生行政部门对医疗事故争议处理申请审查的内容主要包括以下几方面：
1.申请处理的医疗事故争议，是否属于本级卫生行政部门管辖的范围;
2.发生医疗事故争议的医疗主体方，是否具备法定的行医资格，对非法行医活动引起的争议事件卫生行政部门不能按医疗事故争议立案受理;
3.医疗事故争议行政处理申请人，第一，是对患方申请人的认定，是否符合《医疗事故处理条例》规定的处理申请人资格;第二，对医疗机构申请人的认定，如果申请人是医疗机构应当出具医疗机构法定代表签发的申请书和机构执业许可证复印件，以确认其是否为合法医疗机构;
4.是否符合法定的申请处理时限，依据《医疗事故处理条例》规定，医疗事故争议的处理申请，应当在知道或应当知道其身体受到伤害1年内提出，没有正当理由在1年后提出的处理申请不予受理;
5.医疗事故争议处理申请有无明确的争议相对方;
6.是否向人民法院提起诉讼。已向人民法院提起诉讼的医疗事故争议，卫生行政部门不予受理。
当事人有权选择任何一种途径解决事故争议。医疗事故争议发生后，当事人可以根据自己的愿意，决定选择行政处理程序，由卫生行政部门通过调解手段解决争议;也可以直接选择司法程序，提起民事诉讼，由人民法院解决争议。
已经进入民事诉讼程序的，则不能进行行政处理。通过司法程序，是解决医疗事故争议的最终途径，是民事救济的最终手段。对于人民法院发生法律效力的判决书，当事人都必须履行。
二、医疗事故的行政责任
我国实行的是社会主义法制，对医疗事故的处理一般采取批评教育从严，惩罚处理从宽的原则，大多采用行政手段进行调解。如果调解失败，转由司法机构依法处理。法律规定，对造成医疗责任事故的直接责任人员，医疗单位应当根据其事故等级、情节轻重、本人态度和一贯表现，分别给予以下行政处分：
一级医疗事故：记大过、降级、降职、撤职、开除留用察看、开除；
二级医疗事故：记过、记大过、降级、降职、撤职；
三级医疗事故：警告、记过、记大过、降级、降职。
对造成医疗技术事故的直接责任人员，医疗单位应责令其作出书面检查，吸取教训，一般可免予行政处分；对情节严重的，也应当酌情给予行政处分。
三、医疗事故争议的行政处理由哪个部门处理
医疗事故争议的行政处理由医疗机构所在地的县级人民政府卫生行政部门的上一级人民政府卫生行政部门进行管辖。
法律依据：
《医疗事故处理条例》第三十七条
发生医疗事故争议，当事人申请卫生行政部门处理的，应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。