而从功能上来看，玉米考种系统可进行玉米籽粒分析、玉米整穗分析、玉米截面分析。功能上非常全面，能够满足现代玉米考种工作的需要。因此玉米考种系统特别适用于育种公司、农业大学及农业科研机构等。
玉米考种系统应用的，是解决了这些单位以往存在的一些弊端，如人工考种所造成的主观误差大、效率低、成本高等问题。将过去的有损考种变为无损考种，在提高了玉米育种效率的同时，也提高了玉米考种工作的准确率，为现代农业的自动化发展贡献了力量。
农业信息化的发展离不开玉米考种系统这样的农业自动化设备，而仪器的应用对于提高农业生产效率和提高农业生产水平都有重要的促进作用，是适应现代农业发展的需要的，因此玉米考种系统应该在各地区的育种公司、农业大学及农业科研机构等单位推广应用。