微波干燥设备可以有效限度的保留物料中的有效成分。微波干燥还可以有效的杀死各种霉菌和虫卵，防止储存过程中产生的霉变和虫蛀。微波干燥原理是使被干燥物体本身成为发热体，称之为整体干燥方式，不需要热传导的过程，因此能在短时间内达到均匀加热。传统的干燥方式是以煤作燃料燃烧，生成干净的热空气作为干燥介质，以吸收物料内的水分，排掉一定水分的湿空气，往复循环，达到所要求的水分。但传统的干燥方式耗时、费力、不易达到物料干燥所需要求，同时灭菌效果差，加上以煤为燃料对环境的污染。所以，新型微波干燥技术的诞生就显得必要。微波干燥技术的出现，满足了烘干干燥的要求，并且对环境。
微波对生物体的热效应指的是由微波引起的生物组织或者是系统受热而对生物体产生的影响，多功能微波干燥设备也有微波的热效应。热效应主要是指生物体内有极分子在微波高频电场的作用下反复地快速转动而摩擦生热的。
体内离子在微波作用下振动也会将振动能量转化成热量，一般分子也会吸收微波能量后让热运动能量增加。如果生物体组织吸收的微波能量比较少的话，它可以借助自身的热调节系统通过血循环将吸收的微波能量(热量)散发到全身或体外。
微波干燥设备的微波同样也有非热效应。在微波电磁场的作用力下，生物体内的一些分子将会产生变形振动，让细胞膜功能受到一些影响，使细胞膜内外液体的电状况发生变化，引起生物作用的改变，进而会影响到中枢神经系统等。对多功能微波干燥设备的非热效应，人们还了解的不是很多。当生物体受强功率微波照射时，热效应是比较重要的，长期的低功率密度微波辐射主要引起非热效应。