气相色谱仪常常用以有机化合物的定性分析，仪器设备在运作一段时间后，因为静电感应缘故，仪器设备內部非常容易吸咐较多的尘土；线路板及线路板插孔除吸咐有积灰外，还常常和一些有机化学蒸汽吸咐在一起；由于一部分有机化合物的凝点较低，在气相口部位常常发觉凝结的有机化合物，分离管道在应用一段时间后，公称直径变窄，乃至被有机化合物阻塞；在应用全过程中，tcd探测器很有可能被有机化合物环境污染；fid探测器长期用以有机化合物剖析，有机化合物在喷头或搜集极部位堆积或喷头、搜集极一部分积碳常常产生。
一、仪器设备內部的吹扫、清理
气相色谱仪关机后，开启仪器设备的侧边和后边控制面板，用仪表盘气体或n2对仪器设备內部尘土开展吹扫，对积灰较多或不易吹扫的地区用软刷相互配合解决。
吹扫结束后，对仪器设备內部存有有机化合物环境污染的地区自来水或溶剂开展清洗，对水溶有机化合物能够先自来水开展擦洗，对不可以*清理的地区能够再用溶剂开展解决，对非水溶或将会与水产生化学变化的有机化合物用不与之产生反映的溶剂开展清理，如二甲苯、甲苯、等。留意，在擦洗仪器设备全过程中不可以对仪器设备表层或别的构件导致浸蚀或二次污染。
二、线路板的维护保养和清理
气相色谱仪提前准备维修前，断开仪器设备开关电源，用仪表盘气体或n2对线路板和线路板扩展槽开展吹扫，吹扫时要软刷相互配合对线路板和扩展槽中尘土较多的一部分开展细心清除。操作流程中尽可能戴手套实际操作，避免静电感应或手里的汗垢等对电路板上的一部分元器件导致危害。
吹扫工作进行后，应通过观察线路板的应用状况，看印刷线路板或电子元器件是不是有显著被浸蚀状况。对电路板上染上有机化合物的电子元器件和印刷电路用药棉蘸取乙醇当心擦洗，线路板插口和扩展槽一部分还要开展擦洗。