流式细胞仪或其它需要使用荧光染料的仪器配备有激光器，激光器能产生特定波长的光，从而激发能吸收该特定波长的光的荧光染料。然后该荧光染料发射的光通过滤光镜，因此每个传感器只能检测到一定范围内的被滤光镜滤过的荧光。所检测的荧光即为仪器所识别的信号。
目前已研发了许多不同的荧光染料，每种都具有特定的发射和激发光谱。现在，在整个可见光谱范围(包括红外区域)内可以吸收并发射特定波长的光的荧光染料都已经商品化。此外，荧光染料发射光的强度也有区别。荧光染料的亮度取决于其吸收光的能力和吸收光转化为发射光的效率。
如果不借助合适的工具，选择适用于后续实验的荧光染料可能比较困难。如果所设计的实验为需要两种或更多种荧光染料的多色实验时， 选择荧光染料将变得更加困难。在多色实验中，必须注意荧光染料之间的光谱重叠以及其它因素，才能尽量减少可能出现的问题，例如荧光溢出。
关键词：流式细胞仪 传感器