构成妨害植物防疫罪法院的处罚标准是：1、构成本罪的，法院一般会判处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；2、如果单位犯本罪的，法院将对该单位判处相应罚金，并对其相关直接责任人员判处本罪个人犯相应。构成妨害植物防疫罪法院会如何量刑?的法律依据
《刑法》第三百三十七条违反有关动植物防疫、检疫的国家规定，引起重大动植物疫情的，或者有引起重大动植物疫情危险，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚。