买卖违章建筑的合同应当认定无效。违章建筑属于法律法规禁止买卖转让的房屋，未经过登记备案，买卖主体不合法，出卖人就未经批准或者未按照批准内容建设的建筑与买受人订立的买卖合同无效。违章建筑的买卖合同是否有效的法律依据
《城市房地产管理法》第三十八条下列房地产，不得转让：（一）以出让方式取得土地使用权的，不符合本法第三十九条规定的条件的；（二）司法机关和行政机关依法裁定、决定查封或者以其他形式限制房地产权利的；（三）依法收回土地使用权的；（四）共有房地产，未经其他共有人书面同意的；（五）权属有争议的；（六）未依法登记领取权属证书的；（七）法律、行政法规规定禁止转让的其他情形。