杀菌锅可以使用高温蒸汽、热水循环、高温淋水以及水汽混合等方式来进行杀菌。高温蒸汽是通过将高温蒸汽导入到设备内部来对产品进行杀菌操作的，但是其会因为气体所具有的导热性较差，所以会使得设备内部的温度分布的较不均匀。
而在使用热水循环的方式来对产品进行杀菌时，其需要通过*的将产品浸泡在热水之中，并通过对水流进行加热来进行杀菌。热水能够在设备内部均匀的进行循环，从而会使得设备内部能够拥有分布较均匀的温度。
由于设备内部的压力会随着温度的上升而提升，其可能会导致罐装产品在进行杀菌时会出现跳盖等现象产生，所以可以通过将压缩空气导入到设备内部来防止出现这种状况。
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