加工中心光机的立式与卧式两者的工作台形式不同。立加工作台一般为十字滑台结构的t型槽工作台，有两套运动机构负责相互垂直方向的工作台移动，x向进给的工作台覆盖在负责y向进给的导轨之上。卧加的工作台只做x或y向运动，工作台形式一般为点阵螺孔台面的旋转式工作台，相对较容易选装交换式双工作台。
所使用的刀库不同；立加常用斗笠式刀库和圆盘机械手式刀库。卧加常用链式机械手刀库。
联动的轴数不同；常规立加为三轴联动，可以扩展为四轴或者五轴，卧加标配四轴三联动，可以扩展为五轴。立式和卧式加工中心在产品定位和加工应用方面也有所不同。
加工中心光机的立式与卧式两者加工面向对象不同；立加受立柱高度及换刀装置的限制，不能加工太高的零件，所加工工件体积相对较小，如果要实现工件的侧面加工必须加装角度头或者数控转台。卧加在一次装夹后可以完成除安装面和顶面以外的其余四个表面的加工，加工箱体类零件，加装角度头后可以实现五面体加工。
两者加工时的排屑状况不同；立加在加工型腔或下凹的型面时，切屑不易排出，严重时会损坏刀具，破坏已加工表面，影响加工的顺利进行。卧加加工时排屑容易，加工状况相对较理想。
加工中心光机的立式与卧式两者的操控状况有所不同；立加装夹方便，便于操作，易于观察加工情况，调试程序容易。卧加所加工工件普遍比较庞大，装夹困难，不容易监控加工过程，操作调试相对困难。