超微量分光光度计是一类很重要的分析仪器，在物理化学、生物医学、材料学、环境科学、化工冶金等生产管理部门都有广泛而且重要的应用。超微量分光光度计已成为现代分子生物实验室常规仪器，常用于核酸、蛋白定量以及细菌生长浓度等的定量。
常见应用：
1、核酸的定量：核酸的定量是超微量分光光度计使用频率较高的功能。其可以定量溶于缓冲液的寡核苷酸，单链dna、双链dna，以及rna。核酸的zui高吸收峰的吸收波长为260nm。每种核酸的分子构成不一，因此其换算系数不同。定量不同类型的核酸，事先要选择对应消光因子。
2、uv-vis常规可见-紫外检测：全波长超微量分光光度计可以像普通的紫外-可见分光光度计一样行使功能。
3、蛋白质的直接定量(uv法)：这种方法是在280nm波长直接测试蛋白。蛋白质测定过程非常简单，先测试空白液，然后直接测试蛋白质。蛋白质直接定量方法，适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质。紫外直接定量法相对于比色法来说，速度快，操作简单；但是容易受到平行物质的干扰，如dna干扰；另外敏感度低，要求蛋白的浓度较高。
4、比色法蛋白质定量：蛋白质通常是多种蛋白质的化合物，比色法测定的基础是蛋白质构成成分：氨基酸如*、*等与外加的显色基团或者染料反应，产生有色物质。有色物质的浓度与蛋白质反应的氨基酸数目直接相关，从而反应蛋白质浓度。
5、细菌细胞密度测定：实验室确定细菌生长密度和生长期，多根据经验和目测推断细菌的生长密度。在遇到要求较高的实验，需要采用分光光度计准确测定细菌细胞密度。