粉条污水看似简单，但工艺选择至关重要，若工艺选择出现问题，极有可能出现后续一系列问题。一般采用物化法(气浮、混凝沉淀、吸附等)，但其去除效率不稳定、运行费用高、 管理操作不便。近年来也有以好氧法为主的处理技术，对有机物的去除虽较好，但其运行费用较高。而将厌氧好氧相结合的技术，经过在多个厂家的多种食品生产废水处理中的应用表明，该工艺处理效率高、运行费用低、投资较少、操作管理非常简便，二次启动非常便利，出水能达到《污水综合排放标准》(gb 8978—1996)中的一级标准。
1、预处理工序
在预处理工序中，淀粉废水通过格栅、沉淀、气浮等工艺去除悬浮物，减少后续反应器负荷。淀粉废水呈酸性，产甲烷菌不能承受低ph值的环境，抑制厌氧处理过程，因此生化处理前需要调整ph值至中性(其*适宜范围是6.8~7.2)。
2、厌氧生物处理
厌氧生物处理是一种有效处理高浓度有机废水的技术，可将有机化合物转化为低分子有机化合物，并能产生甲烷进行回收利用，减少后续反应负荷。厌氧处理技术可选用uasb、egsb、ic等工艺，其cod去除率可达到80%以上。淀粉糖及变性淀粉生产废水需投加营养盐调节碳氮比后再进行厌氧生物反应。
3、好氧生物处理
好氧生物处理是在有氧环境下对有机物的*分解，其工艺技术有sbr、氧化沟和二沉池等。
目前国内常用的工艺有混凝-水解酸化-uasb-曝气氧化塘工艺、egsb+sbr法、uasb-氧化塘-混凝气浮法等，这些工艺处理淀粉废水效率高，均能使处理后的水达到国家排放标准。