俗话说“母大子肥，好种出好苗”。中药材栽培中种子是关键，有了好的种苗，才能保证达到高产，优质和用药安全有效。因此种子、种苗等首先必须认真鉴别，分清真伪和优劣。对中药长期存在同名异物，同药异名，南北区域和民族间药名叫法不同等问题都要细致考证明白。还有种子新陈及发芽率等须进行测定和试验，才能保证取得好的经济效益。种子和繁殖材料的鉴别须从下面几个方面进行：
1.种子的形态构造。每种药材的种子都有自身的形态、色泽、构造。如麦冬为球形、党参为扁球形，褐色，黄芪的种子为肾形，黄色，桔梗的种子扁椭圆形，黑褐色。当归，白芷的种子都是双悬果，扁平椭圆形，具扁平状翅，当归背面三个棱不甚突出，较小，而白正背面三个棱显著突出，而且比当归种大。贝母种栽鳞茎2瓣，1大1小，中间有l小的心芽；土贝母种栽单个块状、肉质；
2.成分气味。白芥子、黄芥子有富含油脂，有辣味。党参，种尝有腥味；
3.纯净度。按去杂质和空种子后，好种子占总重量的比率确定其好不好；
4.干粒重(或大种子百粒重)。每种药材植物种子的千粒重是固定的，如玫瑰种子的千粒种9.5g，防风的种子干粒重3.1g，荔枝种百粒重178g。多或少说明有问题；
5.含水量指种子含有水分的比率，对种子的储存和运输，发芽都有很大影响。
6.发芽率测定。一般是小粒种子放在砂布或滤纸上，下垫细沙，大的种子直接入在细沙基质中，先于40—45℃浸24小时，放在20—24℃温度下保持湿润培养，测定百分比；
7.有些种子有后熟期，处理后或隔年才出苗。有些种子如人参，细辛、山茱萸、牡丹等，种子收获时胚尚未分化，有后熟期，须进行催芽处理，或隔年才能出苗。另外对其种子的生命力，产量及质量都应作田间对比实验，最后鉴定评价是否为优良种子。
总之，品质优良的种子是药材栽培的最基础物质，是提高其产量和质量的根本保障。品质优良的种子是指物种鉴别正确、种子纯净一致、饱满完整、无病虫、发芽率和活力高、抗逆性和抗病害性强。必要时须通过种子检验来实现。国家专门有种子管理条例。在购买和运输时应通过种子检疫部门检疫，防止带病虫害的种子造成难以补救的损失，以保证提高药材种植的经济效益。