短程分子蒸馏的应用领域比较广，主要体现在以下产品和行业中:
短程蒸馏设备主要用于产品的净化、浓缩和溶剂回收，去除单个分散物，改善和干燥商品的颜色，特别适用于高沸点、热敏性和易氧化物料的分离。目前，有数百种产品可用于短程蒸馏。随着人们对高纯度和天然绿色产品的需求逐渐增加，短程蒸馏技术生产的产品将有更广阔的市场前景。
油化石油的分离和精制，如低蒸气压油、高粘度润滑油的制备、氮氧化合物的分离、焦油、基础油、亮油、甘油等的残留精制。重油蒸馏真空残馏物的蒸馏回收从重油中回收；能源环保废机油再生生物柴油等。
化学工业中用于脂肪酸、脂肪酸酰胺、脂肪醇、表活剂、二聚酸、聚酰胺树脂、脲醛树脂、聚胺酯、异氰酸盐、环氧油等化学中间体的精制和表活剂的净化；高分子醇、烷经、多元醇、乳胺等化学物质的蒸馏；高、低分子量的不饱和混合物蒸馏，如一元或多元不饱和酸高分子芳香化合物净化，如多酚化合物；单一清除，如聚酯和多羟基化合物中单一去除有机酯的浓缩
香族氨基化合物的净化和浓缩沸点溶剂的净化、提纯和回收脂肪酸。
去除酸氟化物中有机溶剂；
液晶净化提纯
制药工业中用于药物中间体的净化及从天然物质中获得的药物产品：维他命e、维生素a、葡萄糖衍生物，氨基酸脂，卵磷脂，β-胡罗卜素等混合油的分离:如:从母液中回收有效成分，如硬脂酸单甘油、月桂酸单甘油、丙二醇脂等。
浓缩提纯有机酸
干燥合成树脂，
高分子物质的脱水脱溶剂工作
在蒸馏过程中，作为反应釜
食品工业中，从动物和植物中获得天然产物：如：辣椒红色素，精制鱼油，eha、dha、获得高浓度乳酸的米糠油、小麦胚芽油、乳酸、天然或合成维生素等。维他命e和维他命b净化单甘脂净化，
从食用油中获得各种脂肪酸；
农药生产农药和农药中间体的净化和精制，如菊花脂质、增效醚、卡松等。
塑料工业中增粘剂型脂类的净化，如树脂塑料、塑料、稳定剂、丙烯酸盐二甘酯、环氧树脂等高分子物质的除臭树脂类物质的精制
高聚物工业，提纯异腈化合物
提纯软化剂，从低聚物中分离单体，环氧树脂蒸馏等
蒸馏涂料工业，聚氨酯预聚物中的溶剂和tdi单等。
分离化妆品工业，如羊毛脂制备羊毛纯羊毛酸，去除化妆品基质中的农药等
香精香料的生成和天然香精香料的净化，如玫瑰油、桂皮油、香根油、香茅油、山苍子油等。
分子蒸馏(moleculardistillation)它是一个连续的蒸馏过程，在高真空值下进行液体分离操作。是国内外工业化开发应用的高新技术，尚未实现大规模工业化。分子蒸馏技术在中国的应用研究起步较晚，目前处于起步阶段。
由于分子有效直径不同，不同类型的分子自由程也不同，即不同类型的分子逸出液位后不与其他分子碰撞的飞行距离也不同。分子蒸馏技术是利用不同类型分子逸出液位(挥发液位)后的平均自由程的不同特性来实现的。轻分子的平均自由程大，重分子的平均自由程小。如果在离液位低于轻分子的平均自由程大于重分子的平均自由程的地方设置一个冷凝面，则重分子只会因为达不到冷凝面而回到原来的液位，从而导致轻分子落到冷凝面。当前，众多研究者已经逐渐了解到短程的优势，并且把该技术已广泛应用于石化、药业、食品、化妆品等领域，这是一个良好的开端和现象。