对于深孔的电火花穿孔机加工，由于加工深度值较大，因此加工过程中的排屑比较困难，很容易发生放电不稳定的现象，甚至发生积碳等异常情况，另外，频繁的二次放电会使加工尺寸难以控制。种种放电不良的现象会导致加工速度缓慢、加工质量异常，因此有必要采用一系列措施来改善这些不良现象。
1）高速抬刀技术。目前*的数控电火花机床大多具有高速抬刀功能，将这一功能应用在深窄部位的加工非常有效，高速跳跃的抬刀动作能将加工部位产生的加工屑有效排出，并且减少了空抬刀时间。
2）c轴作旋转运动。机床配备有c轴时，可使用快速装夹定位夹具装夹电极，使电极与c轴同心，那么在加工中使c轴带动电极作连续不断的旋转运动，可以使加工达到非常稳定的加工状态，大大提高加工速度。
3）摇动加工。可以通过摇动加工方法来改善排屑条件，避免集中放电等不良现象。具体通过对电极选取一个较大的缩放尺寸值，通过摇动加工来补偿尺寸差。
4）调整参数。考虑增大脉冲间隙，减少放电时间，增大抬刀高度等来保证加工的消电离，改善排屑状况。不要认为这样设置参数会降低加工效率，实际上在加工深孔时，只有保证加工的顺利进行才能提高加工效率。
5）下冲油。采用下冲油的方式，并适当加大冲油压力进行排屑。
6）及时清理。应随时进行加工监控，建议在放电不稳定的情况下，停机清理工件、电极加工部位的残留屑。